Amira Extensions

 XImagePAQ

이미지 향상, 간략화, 자동 분할 및 객체, 세포 및 조직 특징의 정량화 및 측정

XImagePAQ자동 분할, Convolution, 객체 분리 (Object Separation)를 수행하고 통계 및 기하학적 정보를 추출하는데 필요한 소프트웨어 도구를 광범위하게 제공 합니다.

  • 이미지 처리 : 이미지 필터, 형태학적 (Morphological) 도구, 쉐이딩 보정 등
  • 이미지 분할 및 분리 : Top-hat, Marker-based Watershed, 자동 임계 분할 등 & Separate Object.
  • 통계 및 분석 : 전역 영상 분석, 개별적 레이블 분석, 형태 계측 확장 등

많은 수의 유사한 구성 요소 (Component)를 가진 이미지 스택을 분석 할 필요가 있을 때, 필요한 도구를 제공합니다.

  • 세포, 소낭 (Vesicles) 및 반점 등의 여러 객체를 측정 및 정량화 하기 위해 설계.
  • 작업 흐름에 필요한 모든 단계 및 부가적인 단계를 설명하는 포괄적인 튜토리얼을 함께 제공.

XNeuro

확산 텐서 영상 (Diffusion Tensor Imaging) 및 관류 (Perfusion) 분석

CT 또는 MRI 영상에서 얻은 이미지를 분석하는 전문 모듈을 제공합니다.

XNeuro확산 가중 MR 영상 (Diffusion weighted MR imaging, DWI):

  • 뇌 또는 근육 등의 조직에서 물 분자 확산 율을 이미지화 하는데 사용.

통계학상의 계산을 사용자에게 제공:

  • 현성 확산 계수 (Apparent Diffusion Coefficient, ADC), 분할 비등방도 (Fractional Anisotropy, FA), 방향성 인코더 칼라 (Directionally encoded color, DEC) 맵을 계산하는데 사용.

확산 텐서 영상 (Diffusion Tensor Imaging, DTI):

  • 사람 또는 영장류의 이미지에서 섬유 경로 (Fiber Tracts) 가시화 및 지역화를 목적으로 여러 모듈에 의해 지원.

확산 텐서 영상 (DTI) 실험 (Experiments):

  • 텐서 (Tensor) 가시화.
  • DEC (Directionally Encoded Color maps).
  • 신경 경로 영상 (Fiber Tractography).

전체 뇌 관류 (Brain perfusion) 분석 지원:

  • MR 또는 CT 이미지의 시간 열 (Time Series) 데이터에서 Contrast Bolus의 트레킹을 기반하여 제공.

XTracing

XTracing필라멘트 검출을 위한 확장

XTracing은 극저온 전자 단층촬영에서 액틴 섬유 또는 미세 소관의 분석, 노이즈 이미지에서 필라멘트 또는 튜브 형상 구조를 검출하고 추적할 수 있습니다.

  • 자동, 반 자동 및 대화 형 도구를 사용하여 분할 및 분석 프로세스를 지원.
  • 다양한 분포와 속성을 계산하고 플로팅.
  • 분류된 섬유 스캔은 특성 및 속성을 기준으로 필터링.

Filament Editor는 철근 콘크리트, 복합 재료, 종이 등과 같은 재료에서 섬유 구조의 3D 이미지를 분석하고 정량화하도록 설계되었습니다.


XMolecular

분자 모델의 시각화 및 분석을 위한 고급 도구를 추가XMolecular

3D 데이터 시각화 를 위한 Amira-Avizo의 강력한 기능과 분자 표면, 분자 인터페이스 또는 구성 밀도 계산과 같은 분자 가시화 및 데이터 분석을 위한 특정 도구를 결합 하였습니다.

  • 분자 표면, 분자 구조 정렬 및 연속 정렬 (Sequences alignment), 구조밀도 (Configuration Density), 분자 궤적 (Molecular Trajectories) 시각화 및 애니메이션 등
  • Amira의 혁신적인 사용자 인터페이스로, Molecular 확장 기능을 쉽게 사용.

가장 일반적인 분자 시각화 작업에 대한 자동 실행 데모 및 단계별 자습서와 함께 제공합니다.


XPoreNetworkModeling

다공성 매체의 특성화 및 모델링을 위한 확장PoreNetwork

이 확장을 사용하면 연결된 영역 세트의 특성화 및 모델링이 가능하며, 해당 영역과 해당 연결을 나타내는 구와 선이 있습니다.

  • 레이블 및 분리된 기공 공간 (Pore space)에서 다른 통계에 액세스 할 수 있으며, 기공 네트워크 코드 (Pore network code)를 읽을 수 있게 허용.
  • 공극 연결 통로 (Pore throat)의 식별 및 분리를 포함.
  • 이 확장은 기공과 그 연결성을 나타내는 모델 (Pore Network Model)로 기공 공간 (Pore space)을 변환하고, 다양한 특성이 색상으로 매핑.
  • 또한 고급 공극 공간 통계 및 속성을 기반으로 한 모델 필터링.

XEarthXDigitalVolumeCorrelation

3D 내부 변위 (Displacement) 및 변형률 (Strain) 측정DVC

이 확장 기능을 사용하면 변형 프로세스 중에 획득 한 객체의 3D 이미지에서 정확한 내부 변위 및 변형 맵을 계산할 수 있습니다.

미세 구조를 기계적 거동 (Mechanical behavior)과 연결하는 것은 산업 분야에서 고성능 부품을 설계하는데 중요합니다.

  • 실험실 / 싱크로트론 X 선 단층 촬영, 광학 단층 촬영 (OCT, OST) 및 MRI와 같은 3D 이미징 기술을 통해 연구원들은 높은 공간 해상도 (미크론 규모까지) 및 시간 해상도 (초 이내)로 현장 (In Situ, 원위치에 있는 그대로의 상태) 실험을 수행 할 수 있음.
  • 이러한 기술은 이질성 (Heterogeneities)에 의해 유도된 국소화, 구성 요소 간의 열적 불일치, 미세 균열, 피로 거동 및 위상 전이와 같이 복잡하고 매우 짧은 현상을 포착하는데 특히 적합.
  • DVC (Digital Volume Correlation)는 재료의 자연스러운 질감을 활용하며 최근에는 실험 역학 (Experimental mechanics), 재료 과학 및 생체 역학에서 강력한 비 접촉식 벌크 변형 측정 기술로 부상.

XWind

시뮬레이션 데이터의 메싱 및 후 처리 (Post-processing)

XWind유동 데이터에서 열 데이터 이르기 까지의 시뮬레이션 데이터 및 응력 (Stress) 데이터의 고급 후 처리를 지원합니다.

  • CFD 및 다중 물리 (Multi-physics)에 대한 광범위한 고급 시각화 및 분석 도구.
  • 기계 (Mechanical), 열 (Thermal) 엔지니어링 및 제조 시뮬레이션.
  • 제조 시뮬레이션 및 미세 구조 예측 (Micro-structure Prediction).
  • 비선형 구조 및 지질 공학 (Geotechnical) 문제.

레이블 이미지에서 직접 시뮬레이션 입력 (경계 조건을 가진 사면체 메시)을 생성할 수 있는 고급 메시 작업실 (Workroom)을 제공


XLVolumeXLVolume

대용량 데이터 관리를 위한 확장

최대 수 테라 바이트의 매우 큰 대용량 볼륨 데이터를 관리하고 시각화합니다.

XLVolume에 사용되는 다중 해상도 기술은 사용 가능한 시스템 메모리의 한계를 넘는 대용량 데이터 세트를 상호작용적으로 시각화 및 탐색 할 수 있습니다.


XpandXPand

맞춤형 모듈 개발을 위한 확장

잘 정리된 C++ API를 통해 새로운 사용자 정의 컴포넌트 개발 및 기능 확장 할 수 있습니다.

  • 파일 리더 (Reader) 및 파일 라이터 (Writer).
  • 가시화 모듈 (특별한 그래픽 표현).
  • 데이터 처리 모듈 (새로운 컴퓨팅 알고리즘).
  • 사용자 정의 GUI 요소 추가 (Qt).

XBioFormats

추가 파일 형식 지원

Glencoe Software와 협력하여 Bio-Formats에서 제공합니다.

150 개 이상의 파일 형식에서 3D 또는 4D+ 이미지와 메타 데이터를 편리하게 로그 할 수 있읍니다.

서로 다른 소프트웨어 패키지와 조직 간의 데이터 교환을 용이하게 하기 위해 XBioFormats Extension은 소유권 (Proprietary) 파일 형식으로 저장된 데이터를 OME 데이터 모델, 특히 OME-TIFF 파일 형식으로 알려진 개방형 표준으로 변환.