XImagePAQ
이미지 향상, 간략화, 자동 분할 및 객체, 세포 및 조직 특징의 정량화 및 측정
자동 분할, Convolution, 객체 분리 (Object Separation)를 수행하고 통계 및 기하학적 정보를 추출하는데 필요한 소프트웨어 도구를 광범위하게 제공 합니다.
- 이미지 처리 : 이미지 필터, 형태학적 (Morphological) 도구, 쉐이딩 보정 등
- 이미지 분할 및 분리 : Top-hat, Marker-based Watershed, 자동 임계 분할 등 & Separate Object.
- 통계 및 분석 : 전역 영상 분석, 개별적 레이블 분석, 형태 계측 확장 등
많은 수의 유사한 구성 요소 (Component)를 가진 이미지 스택을 분석 할 필요가 있을 때, 필요한 도구를 제공합니다.
- 세포, 소낭 (Vesicles) 및 반점 등의 여러 객체를 측정 및 정량화 하기 위해 설계.
- 작업 흐름에 필요한 모든 단계 및 부가적인 단계를 설명하는 포괄적인 튜토리얼을 함께 제공.
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XNeuro
확산 텐서 영상 (Diffusion Tensor Imaging) 및 관류 (Perfusion) 분석
CT 또는 MRI 영상에서 얻은 이미지를 분석하는 전문 모듈을 제공합니다.
확산 가중 MR 영상 (Diffusion weighted MR imaging, DWI):
- 뇌 또는 근육 등의 조직에서 물 분자 확산 율을 이미지화 하는데 사용.
통계학상의 계산을 사용자에게 제공:
- 현성 확산 계수 (Apparent Diffusion Coefficient, ADC), 분할 비등방도 (Fractional Anisotropy, FA), 방향성 인코더 칼라 (Directionally encoded color, DEC) 맵을 계산하는데 사용.
확산 텐서 영상 (Diffusion Tensor Imaging, DTI):
- 사람 또는 영장류의 이미지에서 섬유 경로 (Fiber Tracts) 가시화 및 지역화를 목적으로 여러 모듈에 의해 지원.
확산 텐서 영상 (DTI) 실험 (Experiments):
- 텐서 (Tensor) 가시화.
- DEC (Directionally Encoded Color maps).
- 신경 경로 영상 (Fiber Tractography).
전체 뇌 관류 (Brain perfusion) 분석 지원:
- MR 또는 CT 이미지의 시간 열 (Time Series) 데이터에서 Contrast Bolus의 트레킹을 기반하여 제공.
XTracing
Fiber Structure Tracing
XTracing은 매우 노이즈가 많은 이미지에서 필라멘트 또는 튜브 형상 구조를 감지하고 추적 할 수 있게하여, 예를 들어 전자 단층촬영에서 액틴 섬유 또는 미세 소관의 분석을 가능하게 합니다.
- 매우 노이즈가 많은 전자 단층 촬영에서 필라멘트 또는 튜브와 같은 구조를 감지하고 추적하여 정량화.
- 섬유의 중심선 분할을 위한 자동, 반 자동 및 상호작용적 추적 도구를 제공.
- 섬유 네트워크 및 다른 사상 (Filamentous) 구조에서 두께를 측정.
Filament Editor는 섬유 구조의 3D 이미지를 분석하고 정량화하도록 설계되었습니다.
Skeletonization에 의해 얻어진 공간 그래프 (Spatial graph)를 편집 할 수 있읍니다.
XMolecular
분자 모델의 시각화 및 분석을 위한 고급 도구를 추가
3D 데이터 시각화 를 위한 Amira-Avizo의 강력한 기능과 분자 표면, 분자 인터페이스 또는 구성 밀도 계산과 같은 분자 가시화 및 데이터 분석을 위한 특정 도구를 결합 하였습니다.
- 분자 표면, 분자 구조 정렬 및 연속 정렬 (Sequences alignment), 구조밀도 (Configuration Density), 분자 궤적 (Molecular Trajectories) 시각화 및 애니메이션 등
- Amira의 혁신적인 사용자 인터페이스로, Molecular 확장 기능을 쉽게 사용.
가장 일반적인 분자 시각화 작업에 대한 자동 실행 데모 및 단계별 자습서와 함께 제공합니다.
Amira-Avizo의 특징과 결합:
- 스칼라 또는 벡터와 같은 추가 수량정보 시각화.
- 볼륨 렌더링, 슬라이싱 또는 iso-surfaces 등
- 여러 분자들을 동시에 디스플레이.
- 분자의 각도 및 길이 측정.
- 빠른 볼 및 막대 시각화,
- 유연한 칼라 맵핑 (Color Scheme).
- 입체 영상 지원.
XPoreNetworkModeling
다공성 매체의 특성화 및 모델링을 위한 확장
이 확장을 사용하면 연결된 영역 세트의 특성화 및 모델링이 가능하며, 해당 영역과 해당 연결을 나타내는 구와 선이 있습니다.
- 레이블 및 분리된 기공 공간 (Pore space)에서 다른 통계에 액세스 할 수 있으며, 기공 네트워크 코드 (Pore network code)를 읽을 수 있게 허용.
- 공극 연결 통로 (Pore throat)의 식별 및 분리를 포함.
- 이 확장은 기공과 그 연결성을 나타내는 모델 (Pore Network Model)로 기공 공간 (Pore space)을 변환하고, 다양한 특성이 색상으로 매핑.
- 또한 고급 공극 공간 통계 및 속성을 기반으로 한 모델 필터링.
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XDigitalVolumeCorrelation
3D 내부 변위 (Displacement) 및 변형률 (Strain) 측정
이 확장 기능을 사용하면 변형 프로세스 중에 획득 한 객체의 3D 이미지에서 정확한 내부 변위 및 변형 맵을 계산할 수 있습니다.
미세 구조를 기계적 거동 (Mechanical behavior)과 연결하는 것은 산업 분야에서 고성능 부품을 설계하는데 중요합니다.
- 실험실 / 싱크로트론 X 선 단층 촬영, 광학 단층 촬영 (OCT, OST) 및 MRI와 같은 3D 이미징 기술을 통해 연구원들은 높은 공간 해상도 (미크론 규모까지) 및 시간 해상도 (초 이내)로 현장 (In Situ, 원위치에 있는 그대로의 상태) 실험을 수행 할 수 있음.
- 이러한 기술은 이질성 (Heterogeneities)에 의해 유도된 국소화, 구성 요소 간의 열적 불일치, 미세 균열, 피로 거동 및 위상 전이와 같이 복잡하고 매우 짧은 현상을 포착하는데 특히 적합.
- DVC (Digital Volume Correlation)는 재료의 자연스러운 질감을 활용하며 최근에는 실험 역학 (Experimental mechanics), 재료 과학 및 생체 역학에서 강력한 비 접촉식 벌크 변형 측정 기술로 부상.
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XWind
시뮬레이션 데이터의 메싱 및 후 처리 (Post-processing)
유동 데이터에서 열 데이터 이르기 까지의 시뮬레이션 데이터 및 응력 (Stress) 데이터의 고급 후 처리를 지원합니다.
- CFD 및 다중 물리 (Multi-physics)에 대한 광범위한 고급 시각화 및 분석 도구.
- 기계 (Mechanical), 열 (Thermal) 엔지니어링 및 제조 시뮬레이션.
- 제조 시뮬레이션 및 미세 구조 예측 (Micro-structure Prediction).
- 비선형 구조 및 지질 공학 (Geotechnical) 문제.
레이블 이미지에서 직접 시뮬레이션 입력 (경계 조건을 가진 사면체 메시)을 생성할 수 있는 고급 메시 작업실 (Workroom)을 제공합니다.
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XLVolume
메모리 한계를 넘는 데이터 관리
XLVolume 확장은 모든 하드웨어 및 데이터 구성에 적합한 여러 데이터 관리 및 시각화 기술을 결합:
3D 멀티 해상도 압축 [BP1] 파일 형식.- 데이터 자동 로딩 / 언 로딩.
- 지속적인 개선.
- 전체 해상도 데이터 자동 표시.
- 시야에서만 데이터로드.
- 현재 화면 해상도와 일치하는 데이터 로드.
- 멀티 스레딩 로딩 및 압축 해제.
- 정교한 캐싱 도구.
- 선택적 사용자 정의 고정 해상도 수준.
메모리의 한계를 넘는 데이터 관리:
- 사용 가능한 메인 메모리의 한계를 초과하는 대용량 데이터 세트를 효율적으로 처리.
- 예를 들어, 적은 양의 RAM 또는 32 비트 운영 시스템을 사용하는 컴퓨터.
멀티 해상도 및 관심영역 (ROI) 볼륨 기술을 사용:
- 한계를 극복하고, 대화형 시각화 및 대용량 데이터 탐색이 가능.
- 사용 가능한 자원에 따라, 8GB 보다 큰 이미지 볼륨을 탐색 : 300 GB 보다 큰 데이터 세트를 성공적으로 테스트 완료.
XPand
맞춤형 모듈 개발을 위한 확장
잘 정리된 C++ API를 통해 새로운 사용자 정의 컴포넌트 개발 및 기능 확장 할 수 있습니다.
- 파일 리더 (Reader) 및 파일 라이터 (Writer).
- 가시화 모듈 (특별한 그래픽 표현).
- 데이터 처리 모듈 (새로운 컴퓨팅 알고리즘).
- 사용자 정의 GUI 요소 추가 (Qt).
빠른 어플리케이션 개발:
- 가시화 작업 완료의 시간 절약.
- Amira-Avizo 가시화 시스템을 위한 사용자 정의 확장.
- 새로운 모듈과 데이터 클래스는 기존 모듈 및 클래스의 서브-클래스로 정의.
- 새로운 사용자 정의 확장을 단순화 하기 위해 XPand에는 개발 마법사 (Wizard)가 포함.
XBioFormats
추가 파일 형식 지원
150개 이상의 파일 형식에서 3D 또는 4D+ 데이터를 편리하게 로드:
- Glencoe Software와 협력하여 Bio-Formats 제공.
- 150 개가 넘는 파일 형식에서 이미지와 메타 데이터를 읽을 수 있음.
- 서로 다른 소프트웨어 패키지 및 조직 간의 데이터 교환을 용이하게 하기 위해 XBioFormats Extension은 소유권 (Proprietary) 파일 형식으로 저장된 데이터를 OME 데이터 모델, 특히 OME-TIFF 파일 형식이라는 공개 표준으로 변환.
BioFormats은 이제 XLVolume과 통합 되었습니다.
- Amira-Avizo Software의 XLVolume 확장을 통해 사용할 수 있는 흥미로운 기능 중 하나는 Glencoe의 Bio-Formats를 통해 GB 및 TB 스케일 이미지 데이터 세트를 멀티 해상도 Out-of-Core 데이터 관리 솔루션으로 직접 변환하는 것.
이 전례 없는 통합으로 Bio-Formats이 지원하는 모든 파일 형식에 XLVolume 확장에 포함된 이 입증된 대용량 데이터 관리 기술에 대한 액세스 권한이 부여됨.- Glencoe의 Bio-Formats와 XLVolume 기술의 조합은 양식과 공급 업체에서 대규모 데이터를 시각화 할 때 이전에 볼 수 없었던 유연성과 성능을 제공.
- 변환 과정에서 Bio-Formats이 지원하는 모든 메타 데이터를 사용할 수 있음 : 예를 들어, 다중 타일 수집 중에 기기가 기록한 3D 공간에 데이터 타일을 올바르게 배치 할 수 있음.