고급 이미지 처리 및 정량화
Thermo Scientific Amira Software 용 XImagePAQ 확장은 다양한 고급 이미지 처리 및 정량 도구를 제공
이 도구를 사용하면 이미지 향상 작업을 수행하고 단순화되고 자동화된 분할 워크 플로우를 생성하며 이미지의 개체 (예 : 세포, 뼈 및 기타 조직 기능)에 대한 광범위한 측정 및 정량화 작업을 수행 합니다.
세포 분리 및 정량화
세포 연구에서 과학자들은 자연 환경에서 세포를 이미징 하여 그들의 행동을 관찰 합니다.
- 또한, 동시에 여러 세포를 이미징 해야 함.
- 이것은 통계적 분석을 위해 큰 표본 크기를 얻는 이점이 있지만, 분석 전에 세포를 분리하기 위해 더 정교한 이미지 처리 기술이 필요.
Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장:
- Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장은 연구원이 모든 유형의 이미지 데이터, 셀 모양 및 다양성에 맞게 셀 분리 워크 플로우를 사용자 정의 할 수 있는 다양한 이미지 처리 알고리즘을 제공.
뼈 분리 (Separation)
Micro-CT 이미지 획득은 모든 유형의 뼈 연구에 가장 널리 사용되는 이미징 기술 중 하나입니다.
- 뼈 분석을 위한 첫 단계 중 하나는 뼈 분할 및 개별 뼈로 분리하는 것.
Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장:
- 주변 조직에서 뼈 분할하는 도구를 제공.
- 분할된 뼈는 고급 XImagePAQ 확장 알고리즘으로 분리할 수 있음.
- 그런 다음 크기, 모양 및 방향과 같은 XImagePAQ 확장에서 제공하는 다양한 측정의 사용자 정의 가능한 목록을 사용하여 개별 뼈를 측정할 수 있음.
해면 뼈 (Trabecular bone) 분석
뼈는 일반적으로 두 가지 유형의 골조직 (Osseous tissue)으로 구성됩니다.
- 피질 (Cortical) 및 골소주 (Trabecular) 뼈를 가지고 있어, 뼈에 뻣뻣하고 유연한 성질을 부여.
- 뼈를 분리하고 다른 유형으로 분류한 후, 뼈 연구자들은 종종 골소주 (Trabecular) 뼈 구조의 형태에 관심.
Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장:
- XImagePAQ 확장은 골 소질 (Trabecular) 뼈와 섬유 골 (Cortical bone)을 분리하는 워크 플로우를 지원.
- 두 개의 골조직이 분절되면, 일련의 골 형태 (Bone morphometry) 측정법을 적용하여 골 뼈 구조를 정량화 할 수 있음.
자동 치아 분석
치 과학, 진화 생물학 또는 고생물학의 응용은 종종 근접한 치아를 분리하는 것이 목표입니다.
- 이미징 시스템의 해상도 한계는 전형적으로 전통적인 수단에 의한 치아 분할을 처리하고, 종종 치아 윤곽선을 수동으로 추적해야 함.
Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장:
- XImagePAQ 확장의 고급 분리 알고리즘을 사용하면 이미지 처리 시간을 최소화하고 정확하고 재현 가능한 결과를 제공하는 치아 분리 워크 플로우가 가능함.
조직 텍스처 (Tissue texture) 분리
생물학적 조직의 3D 전자 현미경 데이터는 종종 얇은 구조 또는 이들 구조의 상이한 조직에 의해 분리된 유사한 범위의 그레이 스케일 값을 갖는 높은 정보 밀도로 구성 됩니다.
Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장:
- XImagePAQ 확장을 통해 이미지 처리 워크 플로우가 3D 텍스처 정보를 사용하여 복잡한 조직에서 이러한 다양한 구조를 세그먼트화 할 수 있는 용이성을 보여 줌.
분류 (Classification)를 통한 분할
이미지 분석에서 관심있는 구조는 종종 다른 구조 또는 이미지의 잔존물과 유사한 회색 음영 값을 갖습니다.
- 크기, 모양 또는 기타 측정 가능한 매개 변수로만 구별 할 수 있음.
Amira 소프트웨어의 XImagePAQ 확장:
- XImagePAQ 확장을 사용하면 이러한 구조를 세분화하여 서로 분리하여 거의 100 개의 측정 값을 사용자 정의 할 수 있는 목록으로 정량화하고 관심있는 구조 만 추출 할 수 있도록 카테고리로 필터링 할 수 있음.