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Avizo XMolecular
Pack 분자 구조
(Molecular Structural) 가시화 및 분석: |
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n 다양한 데이터 형식의 분자 모델 인포트(Import). n 다양한 방법으로 분자 가시화 및 입체배좌(Conformational) 변화 분석. n 분자 구조 정렬 및 연속 정렬(Sequences alignment). n 분자궤적(Trajectories)
가시화, 애니메이션 및 구조밀도 (Configuration Density). n 원자 식(Atom
Expression). n Avizo 특징과 결합: - 스칼라 또는 벡터
필드와 같은 추가 수량 정보의 가시화. - 강력한 볼륨 렌더링, 슬라이싱
또는 iso-surfaces 등 - 여러 분자들을 동시에 디스플레이. - 분자의 각도 및 길이 측정. - 빠른 볼 및 막대 가시화, - 유연한 칼라 맵핑
(Color Scheme). - 입체 영상 지원. |
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n 결합각도(Bond
Angle) 타입의 가시화. n 유연하고 편리한 분자 선택(Selection) 도구 및 부분 디스플레이. n 분자 표면(Surface)
가시화 및 추출(Extraction): - 반데르발스(Van
der Waals) 서페이스 및 Solvent Accessible 서페이스. n 분자 궤적(Trajectories)에서
입체배좌(Conformational) 밀도 계산 및 가시화. n 수소결합(Hydrogen
bonds) 가시화, 접촉면 및
표면
계산. n 이차구조(Secondary
Structures) 계산, 분석
및 가시화. n 분자와 필드(Field)를 결합하여 표시. |
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n 단백질 접힘(Protein folding) 시뮬레이션: - 3D 형태는 단백질의 기능을 이해 하는데 많은 도움. n 백본(Backbone) 가시화. n 원자 식(Atom
Expression). n 유연하고 편리한 선택(Selection) 및 편리한 부분 디스플레이: - MoleculeView & BoundAngleView(왼쪽)
및 Selection Brower(오른쪽) |
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지원되는 분자(Molecular) 데이터 형식: n AMBER: Assisted n AMF: Amira Molecule
Format (rw). n DX: APBS DX electrostatic field file (r). n GROMACS: n MAP: Autogrid interaction field file (r). n MDL: MDL file format saving chemical structures (rw). n PDB: Protein data
base file format (rw). n PHI: Congen PHI Electrostatic field file (r). n PSF/DCD
(CHARMM): File format used by CHARMM (r). n Tripos: File format used to save Tripos Sybyl mol2 molecules (rw). n UniChem: File format used by the UniChem molecular
software (rw). n ZIB
Molecular File Format: Structured
molecular file format (rw). |
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Open Inventor & Avizo는 VSG사의 등록상품이며, PHANTOM, OpenHaptics은 SensAble
Technologies사의 등록상표이며, (주)쓰리디 인터페이스는 VSG 사의 제품 군 및 PHANTOM 제품 군을
국내 독점 공급합니다 Omega & Delta 및 Sigma는
ForceDimension 사의 등록상표이며, ForceDimension, SenseGraphics 및 Novint 사의
상기 제품 군의 공식 한국 대리점 입니다.
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